تاریخ محاکمه خالد شیخ محمد که از او به عنوان معمار حملات یازده سپتمبر نام برده می‌شود، تعیین شده است.
خالد شیخ محمد و چهار نفر دیگر در یازده جنوری ۲۰۲۱ در یک دادگاه نظامی در گوانتانامو محاکمه می‌شوند.
مقام‌های آمریکا گفته‌اند این افراد به انجام جرایم جنگی "از جمله تروریسم و قتل نزدیک به سه هزار نفر متهم هستند."
رمزی بن الشبیه، ولید بن عطاش، مصطفی احمد الحوساوی، و عمار البلوچی دیگر متهمان این پرونده هستند. این افراد ۲۰ سال پس از حملات در نیویورک، واشنگتن و پنسیلوانیا محاکمه می‌شوند.
در صورتی که این افراد در جریان دادگاه مجرم شناخته شوند، به اعدام محکوم خواهند شد. خالد شیخ محمد در سال ۲۰۰۳ در پاکستان بازداشت و سه سال بعد به پایگاه آمریکایی در گوانتانامو کوبا منتقل شد.
خالد شیخ محمد به همراه ۴ نفر دیگر به قتل دو هزار و نهصد و هفتاد و شش نفر متهم شده‌اند.
تلاش‌ برای محاکمه این افراد تا کنون با موانعی رو‌به‌رو بوده است.
خالد شیخ محمد در جریان محاکمه‌اش در سال ۲۰۰۸ در دادگاهی نظامی گفت قصد دارد به جرم خود اعتراف کند و "از شهادت در راه خدا استقبال می‌کند."
دولت باراک اوباما می‌خواست محاکمه این افراد در نیویورک انجام شود اما پس از مخالفت‌های گسترده، این تصمیم را تغییر داد. تعطیلی زندان گوانتانامو یکی از وعده‌های باراک اوباما بود که به آن عمل نکرد.
وزارت دفاع آمریکا پیشتر گفته بود که خالد شیخ محمد "اعتراف کرده که او مسئول" حملات بوده است.